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APEX propose régulièrement aux personnels impliqués en recherche des formations portant sur les méthodes et techniques utilisées en anatomo-pathologie (technique d'autopsie et de prélèvement, principes de description lésionnelle...) et en histologie (microscopie confocale, analyse d'images...).

Des séances de formation à l’histomorphométrie sont par exemple régulièrement organisées à la demande de nos interlocuteurs avec comme préoccupation majeure de répondre aux objectifs scientifiques propres de chaque étude. Localement, des interactions fortes existent entre APEX et la plateforme d’imagerie MicroPicell (SFR Santé, Nantes) ce qui donne lieu à la mise en place régulière de formations communes en microscopie confocale et à l’organisation de séminaires dans le cadre de la formation doctorale « SFR santé ».