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Les Journées DE^CODAGE - 12/02/2012
Première Journée sur l'annotation des Eléments Transposables (TEs) - Vendredi 30 Mars 2012 - INRA de Versailles *** Inscription obligatoire ***JOBIM 2012 - 12/02/2012
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM 2012Premier Appel d'Offre GdR BIM - 22/03/2012
Appel d'offre GdR BIM - 04/07/2011
Communauté d'Annotation des Génomes
28 avril 2011
Après le succès de la Journée Satellite "Annotation des Génomes et Génomique Comparative" de JOBIM 2010 à Montpellier, et pour compléter le groupe de travail "Génomique Comparative" déjà existant, une poignée d'entre nous s'est réunie pour créer une communauté francophone ayant un intérêt dans l'annotation des génomes: DE^CODAGE.
Avec l'augmentation constante du nombre des génomes séquencés, mais surtout l'augmentation de la vitesse à laquelle les données sont produites, et les changements de la qualité de ces données, nous entrons dans une phase où l'annotation génomique n'est plus un processus entrepris par un petit groupe d'initiés. De plus en plus de laboratoires ont maintenant la(les) séquence(s) de leur(s) organisme(s) d'intérêt. Mais comment annoter ces séquences, fonctionnellement et structurellement? Quelles différences entre un génome séquencé avec une technique traditionnelle, et un génome séquencé avec du RNAseq? Différents types de données, différentes méthodes d'annotation? Et plus largement: comment stocker ces annotations pour qu'elles soient facilement accessibles? Comment les échanger?
L'ambition de cette communauté est d'inciter les échanges d'idées et les discussions pour le bénéfice de chacun.
DE^CODAGE pour "COmmunauté D'Annotation des GEnomes" ... mais aussi parce qu'annoter des génomes, c'est un peu faire du décodage.