Etudes fonctionnelles

Etudes fonctionnelles

Les données de génomiques sont des premiers éléments pour aborder les mécanismes de régulation de l’expression génique chez les pucerons et notamment dans les grandes fonctions physiologiques, développementales, d’interaction et comportementales qui leur sont propres. Des approches de transcriptomique (RNA-Seq) sur les ARNm et les ARN non-codants, d’épigénétique (méthylation d’ADN, modifications post-traductionnelles des histones) sont autant de ressources génomiques nécessaires à la description de ces fonctions. L’intégration de ces données grâce à la bioinformatique et la modélisation permettra de proposer des réseaux de gènes pour poser de nouvelles hypothèses sur le rôle des programmes génétiques dans ces fonctions.

La démonstration du rôle de gènes clefs doit se faire par des études fonctionnelles visant à modifier l’expression des gènes candidats et étudier l’effet de ces modifications sur les phénotypes attendus. Actuellement, des expériences d’ARN interférence (RNAi) sont disponibles chez les pucerons comme outil fonctionnel, avec des taux de réussite très variables entre tissus ciblés, gènes et laboratoires. En 2019, la nouvelle technique d’édition du génome par mutagenèse dirigée CRISPR-Cas9 a été développée chez le puceron du pois.

Date de modification : 07 février 2023 | Date de création : 14 juin 2012 | Rédaction : Denis Tagu