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MIA Paris

Equipe Statistique & Génome

L'équipe Statistique et génome crée et développe des méthodes statistiques originales, principalement orientées vers les technologies à haut débit issues de la biologie moléculaire. / The Statistique et génome team creates and develops original statistical methods, mainly oriented towards high-throughput technology used in molecular biology.

Responsable : Céline Lévy-Leduc

Thèmes de recherches / Research fields

  • Segmentation et détection de ruptures / Segmentation and change-point detection,
  • Modélisation de séries temporelles / Time series modelling,
  • Modèles de mélange et modèles à structures cachées / Mixture and latent variable models,
  • Analyse et inférence de graphes aléatoires, détection de motifs / Analysis and inference of random graphs, motif detection,
  • Apprentissage statistique (sélection de modèles, sélection de variables, classification / Statistical learning (model selection, variable selection, classification).

Domaines d'application / Application domains

  • Analyse des données génomiques / Genomic data analysis
  • Expression de gènes / Gene expression 
  • Variation du nombre de copies / Copy number variations
  • Interactions protéine-ADN / Protein-ADN interactions
  • Interactions ADN-ADN / DNA-DNA interactions
  • Génomique comparative / Comparative genomics
  • Métagénomique / Metagenomics
  • Génétique d'association / Association studies

Les projets en cours

  • ABS4NGS : projet ANR (investissement d’avenir)
  • Amaizing : projet ANR (investissement d’avenir)
  • CytoPheno : projet ANR
  • HydroGen : projet ANR
  • Epireg : projet INCA
  • Reg4Sel : financement INRA (métaprogramme SelGen)
  • Environmics : financement CNRS (avec l'équipe MORSE)
  • VEGA : projet LEFE/IMAGO (CNRS) 

Les partenariats

  • Collaborations avec des laboratoires de biologie et de bioinformatique :
    • IPS2 (Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay), UMR Génétique Végétale (INRA Moulon), Micalis (INRA Jouy), UMR BIOGECO (INRA Bordeaux);
    • Institut Curie; Institut Pasteur. 
  • Groupes de travail et réseaux méthodologiques 
    • SSB (S&G Evry, MIG+MIAJ=MaIAGE), NetBio;
    • Select (INRIA, Orsay), AIGM. 
  • Animation et coordination 
    • Groupes de travail : StatOmique, PEPI IBIS (Ingéniérie Bioinformatique et Statistique pour les données à haut débit), NetBio, Plante (IMSV);
    • Conférences : SMPGD, AIGM, ABS4NGS (juin 2015);
    • GdR : Génomique environnementale, Stat & Santé, Bioinformatique Moléculaire et Biologie de Synthèse et des Systèmes;
    • Comité de pilotage du CDS (Saclay). 

Pour plus d'informations, voir : [->lien]

Les ANR passées

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Les thèses, post-doc et anciens de l'équipe Stat & Génome

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