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Formation en histologie, bio-imagerie à fluorescence, vidéomicroscopie et microdissection laser sur les plateformes MicroPICell ( IRS UN) et APEX (Oniris)

Dates 7-10 mars 2017

Objectifs

• Acquérir une formation de base théorique et pratique en microscopie : Microscopie confocale, spectrale, biphotonique, TIRF, SIM, PALM/STROM, vidéo microscopie et microdissection laser.
• Acquérir une formation de base théorique et technologique en histologie, immunohistochimie.
• Acquérir une formation de base théorique sur la validation d’un modèle animal.
• Connaître les modalités d’accès et d’utilisation des PF et à certains appareils.
• Initiation à l’analyse d’image.

Programme de la formation

Horaires sur MicroPicell 7 Mars 9-17h, 8 Mars 9h30-17h30

Planning: 4  jours ( 2 jours sur MicroPICell et 2 jours sur APEX)

1-     Microscopie confocale, vidéomicroscopie et microscopie SIM  (Philippe Hulin, Steven Nedellec et Stéphanie Blandin, µPiCell, IRT UN)

Formation théorique 4 heures (Jour 1)

• Préparation des échantillons : principe théorique (Stéphanie Blandin, MicroPICell, site IRS UN)
• Colorations standards et spéciales (Stéphanie Blandin,  MicroPICell, site IRS UN)
• Principes d’immunohistochimie et d’immunofluorescence
• Tissue-MicroArrays

• Rappel des bases de la microscopie photonique. Introduction à la microscopie confocale , microscopie SIM (Philippe Hulin et Steven Nedellec, MicroPICell, site IRS UN)

Formation pratique 12 heures (jour 1+2)

• Initiation à la préparation des échantillons histologiques (paraffine et congélation) (Stéphanie Blandin, MicroPICell, site IRS UN)(4h)
• Observation de différentes colorations sur différents tissus, sur le microscope photonique multi-têtes.

• Formation à l’utilisation d’un microscope confocal et/ou vidéo microscope, microscope SIM (Philippe Hulin et Steven Nedellec, MicroPICell, site IRS UN)(6h)
• analyses des résultats : initiation pratique au traitement et àl’analyse d’images (Perrine Paul-Gilloteaux, Site IRS UN) (2h)

Horaires sur APEX 9 Mars 9-17h, 10 Mars 9-17h

2-     Microscopie spectrale, TIRF, PALM/STROM, biphotonique, histopathologie et microdissection laser (Laurence Dubreil, Thibaut Larcher, Candice Babarit, Lydie Guigand, Romain Fleurisson APEX-UMR703, Oniris)

Formation théorique 4 heures (9 Mars)

• § Validation d’un modèle animal (Thibaut Larcher)(1h15)
• § L’immunomarquage en fluorescence pour le phénotypage tissulaire (Lydie  Guigand) (1h)
• § Introduction à la microscopie confocale spectrale,  biphotonique, TIRF, PALM/STORM (Laurence Dubreil ) (1h15)
• § Introduction à la microdissection laser (Candice Babarit)(30 min)

Formation pratique 12 heures (9 et 10 Mars)

• § Immunomarquages fluorescents  sur coupe de tissus pour la microscopie confocale et la microscopie STORM (Lydie Guigand, APEX-URM703, site Oniris)
• § Initiation à l’utilisation d’un microscope confocal spectral, TIRF, biphotonique, PALM/STORM, microdissection laser (Laurence Dubreil, Romain Fleurisson, Candice Babarit,APEX-UMR70, site Oniris)
• § Lecture de lames, application validation d’un modèle animal (Thibaut Larcher APEX-UMR703)

• § Méthode pédagogique

Lieu : Plateforme MicroPiCell (IRS UN, Nantes), Plateforme APEX (Oniris, Nantes)

Type de formation : formation théorique et pratique en microscopie, histologie, analyse d’image à destination des doctorants

Durée de la formation : 2 X 4 jours (mars 2017)

Public visé : Doctorants

Prérequis : Pas de pré-requis obligatoire pour un accès à la plate-forme

Capacité d’accueil : 5X2 ( 5 étudiants max par session)

Matériel à apporter : Indiquer s’il faut apporter du matériel

Coût : APEX : 80 euros par étudiant, MicroPiCell  80 euros par étudiant soit 160 euros au total par étudiant pour 4 jours de formation.

Organisme de formation : co-portage Oniris/SFR

Co-responsables de la formation

Philippe Hulin, Plateforme MicroPiCell Tel : 02 28 08 03 28

philippe.hulin@univ-nantes.fr

Laurence Dubreil, Plateforme APEX Tel : 02 68 78 73 , 40-31

laurence.dubreil@oniris-nantes.fr