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Traitement des prélèvements tissulaires

Les différents équipements d’ores et déjà disponibles sur la plateforme permettent de traiter des échantillons de natures très différentes quant à leur niveau d'infectiosité, leur taille, leur mode de conservation (frais, congelé, fixé au formol) ou leur traitement préalable (inclusion en paraffine ou en résine).

• Automates de déshydratation
• Station d’enrobage-paraffine
• Automate à coloration
• Automate à immunofluorescence (Discover Ultra, Roche)
• Microtomes rotatifs semi-automatisés (dont un portatif, utilisable en milieu confiné)
• Vibratome
• Cryostats
• Ultramicrotome

Exploration phénotypique tissulaire et cellulaire

• Microscopes motorisés à champ large en lumière blanche (90i Nikon) et en fluorescence (80i Nikon), équipés de caméras couleurs refroidies
• Station Mantra avec caméra multispectrale et logiciel d'analyse dédié au multiplexing (Akoya)
• Microscope confocal C2 Nikon équipé des lasers lasers 405, 488, 543 et 647 nm, détecteurs GaAsp
• Microscope confocal spectral LSM780 Zeiss, raies lasers 405, 458, 488, 514, 561, 633 nm, TPMT, détecteurs GaAsp spectraux
• Module TIRF motorisé, laser 488 nm, laser 561 nm
• Microscope Biphotonique A1RMP Nikon, 4 détecteurs GaAsps, laser Insight Deepsee 680-1300, exploitation double excitation avec la raie 1040 nm, polarisation, détection réflexion/transmission, FLIM picoquant
• Microdissecteur laser LMD 7000, Leica
• Logiciels dédiés à l’analyse d’image (Nikon Imaging Software, ImageJ, Fiji, Qpath, AMIRA, Huygens, Imaris, SyGlass)
• Microscope super-résolution (Nikon NStorm, STochastic Optical Reconstruction Microscopy)
• Microscope à feuille de lumière adapté aux gros échantillons (BLAZE Miltenyi)