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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Cahier des techniques

Le cahier des techniques de l'Inra

Méthodologie en imagerie (2009)

Des développements méthodologiques en imagerie à l'Inra

Ouvrage collectif - Responsable scientifique : Jean-Marie Bonny - Coordonnatrice : Marie Huyez-Levrat

CTh2009_imagerie

L’imagerie recouvre un ensemble de techniques qui caractérisent la morphologie, la nature et l’agencement des constituants de la matière.Du fait des développements méthodologiques actuels le potentiel de l’imagerie s’est considérablement accru en termes d’échelle, de sensibilité, de spécificité, de caractérisation non destructive et de quantification. L’imagerie joue un rôle croissant dans les recherches pour autant, la conduite d’une expérience d’imagerie n’est pas triviale.

Elle requiert généralement trois phases :

- la préparation et mise sous contraintes de l’échantillon ;

- la mise au point de protocoles d’acquisition;

- l’analyse d’images.

A partir du sommaire ci-dessous, téléchargez au format pdf, les articles à partir du numéro de page et les chapitres à partir de leur titre .

Préface Les auteurs

Chapitre 1 - Préparation et mise sous contraintes de l’échantillon

7 Détection semi-automatique de cellules de fruits charnus observés par microscopie confocale 2D et 3D, David Legland et Marie-Françoise Devaux

17 Suivi de la modification des architectures 3D de biopolymères sous sollicitations mécaniques, Christine Delisée, Jérôme Malvestio et Jérôme Lux
23 Essais mécaniques sous microscope, Patrice Marchal

35 Réalisation d’une cellule d’imagerie multimodale, Abdlatif Ben Moussa et Jean-Marie Bonny

Chapitre 2 - Mise au point de protocoles d’acquisition

45 Caractérisation d’émulsions et de suspensions par analyse d’images vidéo, Bruno Novales, Patrice Papineau, Alain Sire et Monique Axelos
51 Suivi de fermentation de la pâte à pain par imagerie, Anne-Laure Réguerre, Hubert Chiron, Aomir Shehzad et Guy Della Valle

63 Association d’un microscope à un système de capture d’image : Analyse d’images par le logiciel ImageJ, Christel Le Bon, Céline Boulard et Pascale Jolivet

69 Imagerie RMN in utero pour la détection non invasive de l’hypoxie aigüe sur modèle ratte, Guy Bielicki, Cécile Keller et Amidou Traoré

75 Mesure de couleur des végétaux, Éric Pietri, Patrice Reling

81 Étude par microscopie à force atomique de l’organisation cœur-couronne de nanoparticules hétéroxylanes-lignine de synthèse modèles des parois végétales lignifiées, Cédric Gaillard et Bernard Cathala

Chapitre 3 - Analyse d’images

93 Macrovision et analyse granulométrique en niveaux de gris pour l’analyse histologique de tissus végétaux, Marie-Françoise Devaux, Alain Sire et Patrice Papineau

101 Méthode de suivi de la taille de particules de caillé dans le lactosérum pendant le processus de fabrication fromagère, Hervé Guillemin, Thomas Cattenoz et Bruno Perret
115 Recalage d’images multimodales : approche méthodologique et application aux images de muscles bovins acquises par auto fluorescence et par résonance magnétique nucléaire, Frédéric Peyrin, Jean-Marie Bonny