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24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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Datapartage

Dépôt des fichiers tabulés dans Data Inra

tabular_data
DataInra permet le stockage de nombreux types de fichiers tabulés (Excel, csv, ...). Les fichiers déposés doivent respecter plusieurs règles.

Lors du téléversement d'un fichier tabulé (un fichier de données en tables comme un fichier Excel) dans DataInra, l'outil procède à une phase dite d'ingestion permettant le bon stockage et l'exploration sur le portail des données.
Une mauvaise ingestion peut causer des erreurs, il est donc important de s'en prévenir en adoptant de bonnes pratiques et des vérifications sur les fichiers déposés.

Remarque : la plupart de ces pratiques ne sont pas seulement valables pour Data Inra mais peut également augmenter l'interopérabilité globale de vos fichiers tabulés.

Cette documentation est à date du 25/06/2019, pour une documentation actualisée, vous pouvez consulter le Guide Data Inra

Vérifications avant l’import

Générique :

  • si votre fichier contient des caractères spéciaux, l’encodage doit être utf-8
  • il ne doit pas y avoir d’en-tête vide
  • il ne doit pas y avoir de cellule manquante (les cellules vides, elles, sont acceptées)

    Exemple d'erreur :
    il manque une cellule.

      

    Exemple accepté :
    la cellule est vide.

    ColA,

    ColB,

    ColC

    ColA,

    ColB,

    ColC

    1     ,

    1     ,

           ,

    2

    3     ,

    4    ,

    5

    3     ,

    4     ,

    5

Fichier Excel :

  • le format doit être xlsx, les fichiers .xls ne sont pas pris en charge, cf. Liste des formats supportés (ainsi que les fichiers .xlsm, cf. point suivant)
  • le fichier ne doit pas contenir de macros

Remarque : si vos fichiers Excel ne correspondent pas à ces critères et ne sont pas modifiables, vous pouvez les mettre en ligne dans une archive .zip, ils ne seront cependant pas accessibles aux outils d’exploration.

Fichier csv :

  • utiliser le séparateur de cellules ou tabulation (Remarque : dans le dernier cas on parlera plutôt de fichier tsv)
  • utiliser le séparateur de décimales .

Vérifications après l’import

  • vérifier que le nombre de lignes et de colonnes indiqués correspondent à ceux du fichier.
  • vérifier que les nombres, les chaînes de caractères et les dates soient bien reconnus comme tels.

Liste des formats supportés

SPSS (formats POR et SAV)

v.7 à 22

STATA

v.4 à 13

R

jusqu'à la v.3

Excel

XLSX seulement (XLS n'est PAS supporté)

CSV (comma-separated values)

(support limité, voir la section dédiée )