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DECODAGE – Communauté d’Annotation des Génomes

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Communauté d'Annotation des Génomes

26/02/14

DE^CODAGE pour "COmmunauté D'Annotation des GEnomes"  ...  mais aussi parce-que annoter des génomes, c'est un peu faire du décodage!

Le site DE^CODAGE a été profondément réorganisé à partir de Janvier 2014. Sa vocation et son ambition restent de synthétiser les éléments clés touchant l'annotation structurale et fonctionnelle des génomes de plantes mais avec un focus plus marqué sur les céréales et notamment le blé tendre, une plante cultivée très importante pour l’alimentation mondiale, tant humaine qu'animale.

Le site DE^CODAGE va en conséquence devenir bilingue. En effet, le site va héberger les pages d'information de pipeline automatique d'annotation structurale et fonctionnelle TriAnnot. Ces pages sont écrites en anglais. D'autre part la partie consacrée aux synthèses sur l'annotation des génomes restera en français. La partie littérature scientifique sera également focalisée sur les céréales et les progrès en cours pour l'annotation des génomes de céréales plus particulièrement, cette partie sera également écrite en anglais.

Faute de ressources financières les Journées DE^CODAGE seront recentrés sur des tutoriels concernant principalement l'utilisation du pipeline d'annotation automatique TriAnnot et la curation manuelle. Ces tutoriels seront organisés à la demande sur le site INRA de Clermont-Ferrand. Les formations pourront être individuelles ou par petit groupe. Elles seront bien évidemment gratuites mais ne prendront pas en charge les frais de déplacement et d'hébergement sur site.

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