En naviguant sur notre site vous acceptez l'installation et l'utilisation des cookies sur votre ordinateur. En savoir +

Menu Logo Principal

EPITREE

Workpackages

L'approche intégrative de EPITREE comprend 5 WorkPackages (WP) :

  • WP1 - Identification de régions candidate pour l'analyse épigénomique par séquençage bisulfite - Leading Scientists: S. Maury (P1), J Tost (P6)
    • Sélection de génotypes de peuplier et de chêne pour le séquençage WGBS (whole-genome bisulfite sequencing)
  • WP2 - Caractérisation de l'étendue de la variation épigénomique dans des populations naturelles et ses conséquences fonctionnelles, en utilisant les régions candidates préalablement identifiées et une approche basée sur la capture de séquence suivie de séquençage de type bisulfite - Leading Scientists: V Segura (P2), C. Plomion (P3)
    • Caractérisation de l'étendue de la variation épigénomique dans des populations naturelles de chêne sessile (Q. petraea) et de peuplier noir (P. nigra) pour évaluation des conséquences fonctionnelles
  • WP3 - Caractérisation de l'étendue de la plasticité épigénomique en réponse aux contraintes environnementales et à ses conséquences fonctionnelles - Leading Scientists: Regis Fichot (P1), G. Le Provost (P3)
    • Quantifier l'étendue des interactions G × E pour les variations épigénomique, transcriptomique et phénotypique
    • Caractériser les interactions G×E à travers les normes de réaction et les indices de plasticité
  • WP4 - Modélisation des relations multi échelles entre des traits quantitatifs et leurs déterminants moléculaires - Leading Scientists: Jérôme Salse (P4) and Christophe Ambroise (P5)
    • Développer des méthodes statistiques au travers d'un framework bioinformatique, pour intégrer des données hétérogènes à différentes échelles et analyser leur pertinence pour la prédiction phénotypique
    • Intégration de l'expression des gènes et des données de méthylation
    • Impact de l'évolution à long terme sur l'adaptation à court terme des arbres
  • WP5 - Coordination et diffusion des résultats du projet auprès de la communauté scientifique internationale, de réseaux scientifiques ou professionnels, des étudiants et du grand public
    • Gestion scientifique et administrative
    • Dissémination
    • Activités d'enseignement