Phénobois

Phénobois

Nom de la plateforme
Plateforme Phénobois
Localisations
Site d’Orléans: 2163, avenue de la pomme de pin - CS 40001 Ardon - 45075 ORLEANS
Site de Bordeaux-Cestas: 69, route d'Arcachon - 33610 CESTAS
Site de Bordeaux-Pessac: Université Bordeaux 1, Bâtiment B2 - RdC Est - Allée Geoffroy St-Hilaire - CS 50023 - 33615 PESSAC
Site de Clermont-Crouël: 5, chemin de Beaulieu - 63000 CLERMONT-FERRAND
Site Web
https://www6.inrae.fr/phenobois
Phenobois_localisation_mission
Description

Phénobois est une plateforme spécialisée dans l’analyse des propriétés physico-chimiques du bois et hydrauliques des arbres. Créée en 2008, elle comprend du personnel hautement qualifié et des équipements technologiques de pointe distribués au sein de trois unités de recherche : BioForA (Centre Val de Loire, site d’Orléans), BIOGECO (Centre Nouvelle-Aquitaine-Bordeaux, sites de Cestas et Pessac) et PIAF (Centre Auvergne-Rhône-Alpes, site de Crouël).

Les outils de phénotypage développés par Phénobois permettent de (1) caractériser le bois et comprendre les processus d’élaboration de ce tissu, (2) étudier l’adaptation et la réponse des arbres au stress hydrique, (3) identifier les ressources génétiques forestières capables de s’adapter aux climats changeants de demain tout en produisant du bois de qualité et en quantité.

Phénobois met en œuvre une approche multi-échelle allant de la cellule jusqu’à la caractérisation du bois des arbres issus de populations naturelles ou des programmes d’amélioration génétique. Selon les technologies mises en œuvre, la plateforme atteint des capacités d’analyses à haut débit, soit plusieurs milliers d’échantillons par an.

Phénobois répond aux besoins de la communauté scientifique académique nationale, internationale et des acteurs industriels pour progresser dans l’analyse des grandes problématiques d’avenir concernant la forêt et la sylviculture.

Ainsi, Phénobois :

  • Accompagne ses utilisateurs dans la construction de leurs projets de recherche en évaluant les moyens humains, financiers et techniques nécessaires
  • Réalise des développements méthodologiques innovants et assure une veille technologique active pour maintenir un niveau technique d’excellence,
  • Met à disposition ses ressources matérielles pour une utilisation autonome, auprès d’utilisateurs qu’elle a préalablement habilités à cette utilisation
  • Accompagne ses utilisateurs dans la valorisation des données

Forte de ces missions, Phénobois est labellisée “Infrastructure Scientifique Collective INRAE ” depuis 2018, "Plateforme de l'Université de Bordeaux" depuis 2019. Phénobois a également obtenu sa certification ISO 9001 : 2015 le 9 janvier 2023 intitulée « Mise en œuvre et développement d’appréciations directes ou indirectes de paramètres phénotypiques en lien avec les propriétés structurales, physiques et chimiques du bois ». Le périmètre de certification couvre les activités de préparation d’échantillons, broyage, chimie du bois, spectrométrie infrarouge et microtomographie des sites d’Orléans, Bordeaux-Cestas et Clermont-Crouël.

Services

Phenobois propose une diversité de mesures d’appréciation directe ou indirecte de paramètres phénotypiques en lien avec les propriétés physico-chimiques du bois et hydrauliques des arbres.

Prestations

Site réalisant le travail

Préparation d’échantillons - broyage - tamisage – distribution de biomasse

 

Broyage au broyeur à bille Restch MM400

Orléans

Broyage avec le broyeur ultracentrifuge Restch ZM200

Orléans

Broyage au broyeur à couteaux Restch SM2000

Orléans

Broyage avec l'agitateur SK550

Orléans/
Bordeaux Cestas

Distribution robotisée de biomasse en plaque 96 puits

Orléans

Tamisage

Orléans

Préparation d’échantillons -lyophilisation - séchage

 

Lyophilisation

Orléans

Séchage en étuve

Orléans

Analyses chimiques

 

Extraction des composés phénoliques

Orléans

Dosage des composés phénoliques totaux au réactif FOLIN

Orléans

Dosage des composés phénoliques par HPLC/DAD

Orléans

Extractions des sucres solubles

Orléans

Dosage des sucres par HPLC/DEDL

Orléans

Dosage de l'amidon au réactif GOPOD

Orléans

Extraction et dosage des lipides totaux (réactif vanilline)

Orléans

Détermination du potentiel de saccharification
(dosage du glucose issu de la cellulose au réactif GOPOD)

Orléans

Dosage des extractibles par gravimétrie
(obtention du résidu pariétal)

Orléans

Dosage des lignines Klason par gravimétrie

Orléans

Dosage des hémicelluloses et cellulose
(quantification par HPLC des sucres en C5 et C6 libérés après hydrolyse acide)

Orléans

Détermination des cendres par gravimétrie après chauffage à 550°C

Orléans

Spectrométrie infra-rouge

 

Acquisition des spectres spectromètre
PerkinElmer Frontier ou Bruker-MPA

Orléans/
Bordeaux Cestas

Location SPIR portable journée

Orléans

Location SPIR portable semaine

Orléans

Expertise scientifique : Définition du besoin et conception
de l'échantillonnage, spectromètres labo et portables

Orléans/
Bordeaux Cestas

Expertise scientifique : Analyse des spectres et création
de modèle de calibration, spectromètres labo et portables

Orléans/
Bordeaux Cestas

Expertise scientifique : Analyse des spectres et
utilisation de modèle de calibration, spectromètres labo et portables

Orléans/
Bordeaux Cestas

Microdensitométrie

 

Découpe de barreaux à la scie à ruban

Bordeaux Cestas

Découpe des planchettes à la scie à lames jumelles

Bordeaux Cestas

Dérésinage (traitement au pentane)

Bordeaux Cestas

Radiographie aux rayons X et développement film radio

Bordeaux Cestas

Analyse microdensitométrique sous Windendro avec scan

Bordeaux Cestas

Expertise scientifique : Analyses des données

Orléans

Mesure des propriétés physiques et mécaniques du bois

 

Mesure de l'infradensité du bois

Orléans

Mesure de la couleur (modèle CIELab),
spectrocolorimètre Konica-Minolta

Orléans

Mesure des propriétés hydrauliques des arbres et des plantes

 

Espèces vulnérables :  pour 100 Vulnerability Curve (VC),
CAVI STANDARD

Bordeaux Pessac/Clermont

Espèces résistantes :  pour 60 VC, CAVI STANDARD

Bordeaux Pessac/Clermont

Espèces vulnérables, vigne : pour 50 VC, CAVI 1000

Bordeaux Pessac

Espèces vulnérables, tropicales : pour 25 VC, CAVI 1000

Bordeaux Pessac

Espèces résistantes, chêne vert : pour 25 VC, CAVI 1000

Bordeaux Pessac

Herbacées : pour 20VC, CAVI SMALL & MEDIUM

Bordeaux Pessac/Clermont

Espèces vulnérables pour 5 VC, EMBOLIVE

Bordeaux Pessac

Espèces résistantes pour 5 VC, EMBOLIVE

Bordeaux Pessac

Traitement d'images pour 5 VC, EMBOLIVE

Bordeaux Pessac

Microscopie Phenom pro Desktop SEM &
Métalliseur Cressington 108 Auto (accès au matériel par 1/2 journée)

Bordeaux Pessac

Micromotomographie à Rayon X

 

Micromotomographie à Rayon X (accès au matériel par 1/2 journée)

Clermont

Personnel
Phenobois_organigramme
Modalités d'accès

La plateforme Phénobois souhaite amener son expertise au plus tôt dans l'élaboration des projets de recherche auxquels elle participe. Aussi nous vous encourageons à nous contacter dès le montage de votre projet, pour que nous puissions nous impliquer dans votre réponse aux différents appels d'offre.

Tout contact doit se faire par courriel : contact-phenobois@inrae.fr. Vous serez alors orienté vers votre correspondant Phénobois avec lequel vous pourrez échanger, présenter votre projet scientifique et formuler vos attentes vis-à-vis de la plateforme. Vous recevrez un avis quant à la faisabilité de votre projet selon les modalités de sélection décrites dans la charte d’accès à la plateforme, ainsi qu’une estimation du coût et des délais de réalisation. Le démarrage du projet est conditionné par votre acceptation formelle du devis en envoyant le document validé au correspondant Phénobois.

Pour tout projet recevable, Phénobois s'engage à mettre à disposition du personnel formé et compétent, proposer des équipements performants et entretenus, apporter une assistance technique voire une expertise scientifique, réaliser les analyses ou former les utilisateurs à leur réalisation, informer de l'état d'avancement du projet et accompagner les utilisateurs dans la valorisation de leurs données.

Unité d'accès et coût

Les tarifs proposés par Phénobois dépendent des analyses, des expertises mises en œuvre et de l’organisme d’affiliation du demandeur.

Nous identifions 4 niveaux :

  • Tarif interne : appliqué aux utilisateurs des unités d'adossement BIOFORA, BIOGECO et PIAF
  • Tarif INRAE : appliqué à toutes les autres unités de l’Institut
  • Tarif organismes publics : appliqué à l’ensemble des partenaires publics ou assimilés (Universités, ONF, CNRS,   IRD,  CIRAD, …) français, européens et internationaux.
  • Tarif secteur privé : applicable aux utilisateurs des entreprises de statut privé françaises et internationales.

 

 

Phénobois applique les règles de prévision de recettes internes (payé sur crédit INRAE) et externes (payé hors crédits INRAE) de l’Institut, avec le calendrier budgétaire associé. Dans ce cadre, aucune analyse ne pourra être facturée entre octobre et décembre de l’année en cours si le projet n’a pas été prévu avant fin août. Les bons de commandes devront, dans ce cas, être envoyés avant la fin octobre de l’année afin que la facturation soit validée pour l’année budgétaire en cours. La seule exception à ce cycle budgétaire s’applique aux unités INRAE ayant affiché la plateforme comme partenaire lors de l’établissement du contrat de recherche.

Équipements

PhenoBois met au service de la communauté scientifique un parc d’équipements de pointe diversifié ainsi que des équipements prototypes innovants parfois uniques (Cavi1000 par exemple). Le tableau suivant présente les principaux instruments mis à disposition pour les expérimentations.

Phenobois_equipement

Date de modification : 16 août 2023 | Date de création : 23 mars 2018 | Rédaction : Nathalie Boizot (INRAE)