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MIA Paris

Vincent Brault

Maître de conférences à Grenoble

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Thèmes de recherche : Modèle des blocs latents, Sélection de modèle, Inférence bayésienne, Classification non supervisée, Critère ICL, Approximation variationnelle, Algorithme EM, Segmentation, LASSO

4ème étage, aile Claude Bernard
AgroParisTech (département MMIP)
16, Rue Claude Bernard
F-75231 Paris Cedex 05
France
vincent . brault [attention] imag . fr
+ 33 (0) 1 44 08 72 16

Articles

Articles publiés

[P3] BRAULT V. et MARIADASSOU M. Co-clustering through Latent Bloc Model: a Review, numéro spécial du JSFdS, vol. 156, No 3, 2015. Lien vers l'article.

[P2] BRAULT V. et LOMET A. Revue bibliographique pour la classification croisée, JSFdS, Vol. 156, No 3, 2015. Lien vers l'article.

[P1] KERIBIN C., BRAULT V., CELEUX G. et GOVAERT G. Estimation and Selection for the Latent Block Model on Categorical Data, Statistics and computing, pages 1-16, 2014. Lien vers l'article. Rapport de recherche INRIA. Vidéos relatives à cet article.

Articles acceptés

[A4] BRAULT V., DELATTRE M., LEBARBIER E., MARY-HUARD T. et LEVYLEDUC C. Estimating the number of change-points in a two-dimensional segmentation model without penalization, accepté dans Scandinavian Journal of Statistics. Version arXiv:1506.03198Vidéos relatives à cet article.

Articles soumis

[S5] BRAULT V., CHIQUET J. et LÉVY-LEDUC C. A Fast Approach for Multiple Change-point Detection in Two-dimensional Data, soumis. Version arXiv:1603.03593. Vidéos relatives à cet article.

[S6] BRAULT V., OUADAH S., SANSONNET L. and LÉVY-LEDUC C. Nonparametric homogeneity tests and multiple change-point estimation for analyzing large Hi-C data matrices. Version arXiv:1605.03751

Articles en préparation

[Pr1] BRAULT V., KERIBIN C. et MARIADASSOU M. Consistence and asymptotic normality for the maximum likelihood estimator in the latent block model.

[Pr2] BRAULT V. et CHANNAROND C. Algorithm Largest Gaps.

Implémentations

Package R blockseg, avec Julien Chiquet, nous avons conçu et maintenons le package blockseg implémentant les algorithmes développés dans l’article [S5]. Ce package utilise du C++ et des classes S4.

Package R Capushe, j’ai conçu et je maintiens le package Capushe du logiciel R pour la sélection de modèle par contraste pénalisé basée sur le principe de l’heuristique de pente développé par Baudry, Maugis et Michel (2011). Ce package utilise des classes S4.

Package R Blockcluster, depuis 2012, je collabore avec l’équipe MODAL de l’INRIA de Lille Europe dans l’amélioration du package Blockcluster du logiciel R pour l’estimation des modèles de blocs latents. Les algorithmes et critères que je propose dans [P1] sont en cours d’implémentation ; je réfléchis également à une procédure utilisant les résultats de [Pr2]. Les principaux challenges sont de fournir un package facile d’utilisation et pouvant proposer des résultats sur des grandes matrices en peu de temps.

Conférences et communications orales

Conférences internationales sans acte

2016 - BRAULT V. Fast bi-dimensional segmentation for Hi-C data, Statistical Methods for Post Genomic Data, Lille, invité.

Conférences internationales avec acte

2016 - BRAULT V., CHIQUET J. et LÉVY-LEDUC C. Fast Detection of Block Boundaries in Block-wise Constant Matrices, International Conference on machines Learning and Data Mining, New York.

Conférences nationales avec acte

2016 - BRAULT V., KERIBIN C. et MARIADASSOU M. Normalité asymptotique de l'estimateur du maximum de vraisemblance dans le modèle de blocs latents, 48èmes Journées de Statistique, Montpellier.

2016 - BRAULT V., CHIQUET J. et LÉVY-LEDUC C. Estimation des frontières des blocs d’une matrice constante par blocs, 48èmes Journées de Statistique, Montpellier.

2016 - BRAULT V., LÉVY-LEDUC C., OUADAH S. et SANSONNET L. Approche nonparamétrique pour la détection de ruptures appliquée aux données Hi-C, 48èmes Journées de Statistique, Montpellier.

2015 - BRAULT V. L’algorithme Largest Gaps, un algorithme théorique pour le modèledes blocs latents, XXIIes Rencontres de la société Francophone de Classification, Nantes.

2015 - BRAULT V. Vraisemblance autopénalisante pour la sélection du nombre de ruptures dans la segmentation bidimensionnelle utilisée pour l’analyse des données Hi-C, 47èmes Journées de Statistique, Lille.

2014 - BRAULT V., CELEUX G. et KERIBIN C. Mise en oeuvre de l’échantillonneur de Gibbs pour le modèle des blocs latents, 46èmes Journées de Statistique, Rennes.

2013 - BRAULT V. Modèle des blocs latents et algorithme Largest Gaps, Cinquièmes Rencontres des Jeunes Statisticien-ne-s, Aussois.

2012 - BRAULT V., CELEUX G. et KERIBIN C. Régularisation bayésienne du modèle des blocs latents, 45èmes Journées de Statistique, Bruxelles.

2012 - BRAULT V., BAUDRY J.P, MAUGIS-RABUSSEAU C. et MICHEL B. Package Capushe pour le logiciel R, 45èmes Journées de Statistique, Bruxelles.

2012 - BRAULT V., BAUDRY J.P, MAUGIS-RABUSSEAU C. et MICHEL B. Package Capushe pour le logiciel R, Première rencontre R , Bordeaux.

Conférences nationales sans acte

2016 - BRAULT V. Sélection du nombre de blocs d'une matrice constante par blocs bruitée, ANR calibration, Nice, invité.

2016 - BRAULT V. Une méthode rapide pour la co-segmentation des matrices de grandes tailles : application aux données Hi-C, Les journées Bioinformatiques de l’INRA, Toulouse, invité.

2015 - BRAULT V., CHIQUET J. et LÉVY-LEDUC C. Une méthode rapide de segmentation bidimensionnelle pour des matrices de grandes tailles, journées NetBio, AgroParisTech, Paris, invité.

2014 - BRAULT V. Modèle de mélange, Première journée YSP, Paris.

2012 - BRAULT V., CELEUX G. et KERIBIN C. Régularisation bayésienne du modèle des blocs latents, WorkShop ClasSel, IHP, Paris, invité.

Séminaires et groupes de travail

2016 - BRAULT V. Segmentation bidimensionnelle rapide pour l'étude des données Hi-C

  •  Séminaire de l'UTC, Compiègne.

2016 - BRAULT V. Une méthode rapide de segmentation des lignes et des colonnes pour des matrices de grandes tailles

  •  Séminaire de Statistique de Grenoble, Grenoble.

2015 - BRAULT V. L’algorithme Largest Gaps : un algorithme rapide pour le modèle des blocs latents

  •  Séminaire Informatique Paris 5, Paris Descartes.

2015 - BRAULT V., CHIQUET J. et LÉVY-LEDUC C. Fast bi-dimensional segmentation for HiC data

  • Changepoint day, Royal Statistical Society, Londres.

2015 - BRAULT V. Deux modèles pour l’étude des données Hi-C

  • Séminaire de Statisitque du Laboratoire J.-A. Dieudonné, Université de Nice - Sophia Antipolis, Nice.

2015 - BRAULT V., CHIQUET J. et LÉVY-LEDUC C. Méthode rapide de segmentation bidimensionnelle pour des matrices de grandes tailles

  • Séminaire Parisien, IHP, Paris.
  • Séminaire Télécom, Télécom, Paris.
  • Workshop de l’ANR ABS4NGS, Université de Lyon 1, Lyon.

2015 - BRAULT V., DELATTRE M., LEBARBIER E., LÉVY-LEDUC C. et MARY-HUARD T. Vraisemblance autopénalisante pour la sélection du nombre de ruptures dans la segmentation bidimensionnelle utilisée pour l’analyse des données Hi-C

  • Séminaire de statistique de l’IRMAR, Université Rennes 2, Rennes.
  • Séminaire SSB, INRA, Jouy-en-Josas.
  • Groupe de travail statistique et imagerie, université Paris Dauphine, Paris.

2014–2015 - BRAULT V. Modèle des blocs latents : entre théorie et pratique

  • Séminaire de statistique, Université de Strasbourg, Strasbourg.
  • Séminaire de probabilités et statistique, Université d’Angers, Angers.
  • Séminaire de probabilités et statistique, Université Lille 1, Lille.

2013 - BRAULT V., CELEUX G., GOVAERT G., KERIBIN K. Comparaisons de différents algorithmes pour le modèle des blocs latents

  • Séminaire Agro-Select, AgroParisTech, Paris.

2012–2013 - BRAULT V. Approche bayésienne du modèle des blocs latents

  • Séminaire des doctorants du LSTA, LSTA, Paris.
  • Groupe de Travail des Thésards du Laboratoire de Probabilités et Modèles Aléatoires des Universités Pierre et Marie Curie et Denis Diderot, Paris.

2012 - BRAULT V., CELEUX G. et KERIBIN C. La classification simultanée des lignes et des colonnes d’un tableau

  • Groupe de Travail Select, Université Paris-Sud, Orsay.
  • Groupe de Travail Neurospin, CEA, Bures-sur-Yvette.

2012 - BRAULT V. Modèle des blocs latents

  • Séminaire des doctorants d’Orsay, Université Paris Sud, Orsay.

Voir aussi

Mon site interactif :

Vous pouvez retrouver les vidéos que je présente en conférence sur ma chaîne Youtube :