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Réseau NACRe

Equipe NACRe 20 : Département d’Oncogénétique du Centre Jean Perrin - CBRV

Inserm U 1240, Clermont-Ferrand - Cancéropôle CLARA

Pr Yves-Jean Bignon, directeur
© Inra, 2017
L'équipe étudie les marques épigénétiques méthylantes et acétylantes dans les cancers sporadiques du sein et de la prostate et leurs tissus sains correspondants. Les effets de différentes substances telles que les œstrogènes et phyto-estrogènes mais aussi différents traitements anti-histone déacétylases (NaBu et SAHA) et anti-histone méthyltransférases (DZNeP) sur la modulation des marques des histones dans les cancers hormonodépendants du sein ou de la prostate sont étudiés.

Pr Yves-Jean Bignon, directeur

Centre biomédical de recherche et de valorisation
28, place Henri Dunant, BP 38
63001 Clermont-Ferrand cedex 1

Correspondante NACRe : Dominique Bernard-Gallon
  

BERNARD-GALLON Dominique

HDR
Ingénieur Biologiste CJP

BIGNON Yves-Jean

HDR, MD
PU-PH CJP

DAURES Marine

Doctorante

GUY Laurent

HDR, MD
PU-PH CHU

JUDES Gaëlle

Post-Doctorante

RIFAI Khaldoum

Doctorant

Approche spécifique de la thématique

De nombreuses études montrent que la modification des histones serait associée au développement et à la progression du cancer. Les modifications post-traductionnelles des histones sont essentielles pour la régulation transcriptionnelle des gènes.

Dans le cas du cancer de la prostate, une étude par microarrays a permis d’établir la distribution de H3K27me3 à l’échelle du génome en relation avec les paramètres clinicopathologiques. Le profil d’expression d’une vingtaine de gènes a montré une discrimination significative par analyse transcriptomique à l’aide de TaqMan Low Density Arrays (TLDA) sur des biopsies de prostate représentant deux groupes tumoraux (score de Gleason > 7 et ≤ 7) et un groupe sain.

D’autre part, dans le cas du cancer du sein nous avons étudié le pourcentage de recouvrement des 3 modifications de l’histone H3 dont l’acétylation (H3K4ac et H3K9ac) et la méthylation (H3K27me3) sur le promoteur d’un panel de gènes. L’analyse réalisée sur 192 tumeurs du sein et leurs tissus sains associés a mis en évidence des signatures épigénétiques permettant de caractériser les différents sous-types moléculaires du cancer du sein (Classification de St-Gallen).

Publications récentes dans la thématique Nutrition et Cancer

Dans des journaux scientifiques internationnaux

  • Karsli-Ceppioglu S, Dagdemir A, Judes G, Lebert A, Penault-LLorca F, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. The epigenetic landscape of promoter genome-wide analysis in breast cancer. Sci Rep. 2017 (In press).
  • Ngollo M, Lebert A, Daures M, Judes G, Rifai K, Dubois L, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Global analysis of H3K27me3 as an epigenetic marker in prostate cancer progression. BMC Cancer. 2017 Apr 12;17(1):261. [Résumé PubMed PMID 28403887]
  • Judes G, Rifaï K, Daures M, Dubois L, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. High-throughput «Omics» technologies: New tools for the study of triple-negative breast cancer. Cancer Lett. 2016 Nov 1;382(1):77-85. [Résumé PubMed PMID 26965997]
  • Judes G, Dagdemir A, Karsli-Ceppioglu S, Lebert A, Dauplat MM, Rifaï K, Daures M, Dubois L, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. Molecular and epigenetic biomarkers in luminal androgen receptor: a triple negative breast cancer subtype. OMICS. 2016 Oct;20(10):610-13. [Résumé PubMed PMID 27326890]
  • Dagdemir A, Judes G, Lebert A, Echegut M, Karsli-Ceppioglu S, Rifaï K, Daures M, Ngollo M, Dubois L, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Epigenetic modifications with DZNep, NaBu and SAHA in luminal and mesenchymal-like breast cancer subtype cells. Cancer Genomics Proteomics. 2016 Jul-Aug;13(4):291-303. [Résumé PubMed PMID 27365379]
  • Judes G, Dagdemir A, Karsli-Ceppioglu S, Lebert A, Echegut M, Ngollo M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. H3K4 acetylation, H3K9 acetylation and H3K27 methylation in breast tumor molecular subtypes. Epigenomics. 2016 Jul;8(7):909-24. [Résumé PubMed PMID 27424567]
  • Daures M, Ngollo M, Judes G, Rifaï K, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. The JMJD3 histone demethylase and the EZH2 histone methyltransferase in prostate cancer. OMICS. 2016 Feb;20(2):123-5. [Résumé PubMed PMID 26871869]
  • Judes G, Rifaï K, Ngollo M, Daures M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. A bivalent role of TIP60 histone acetyl transferase in human cancer. Epigenomics. 2015;7(8):1351-63. [Résumé PubMed PMID 26638912]
  • Ollier M, Radosevic-Robin N, Kwiatkowski F, Ponelle F, Viala S, Privat M, Uhrhammer N, Bernard-Gallon D, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Bidet Y. DNA repair genes implicated in triple negative familial non-BRCA1/2 breast cancer predisposition. Am J Cancer Res. 2015 Jun 15;5(7):2113-26. [Résumé PubMed PMID 26328243]
  • Karsli-Ceppioglu S, Ngollo M, Judes G, Penault-LLorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. The role of soy phytoestrogens on genetic and epigenetic mechanisms of prostate cancer. Enzymes. 2015;37:193-221. [Résumé PubMed PMID 26298461]
  • Karsli-Ceppioglu S, Ngollo M, Adjakly M, Dagdemir A, Judes G, Lebert A, Boiteux JP, Penault-LLorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Genome-wide DNA methylation modified by soy phytoestrogens: role for epigenetic therapeutics in prostate cancer? OMICS. 2015 Apr;19(4):209-19. [Résumé PubMed PMID 25831061]
  • Ngollo M, Lebert A, Dagdemir A, Judes G, Karsli-Ceppioglu S, Daures M, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. The association between histone 3 lysine 27 trimethylation (H3K27me3) and prostate cancer: relationship with clinicopathological parameters. BMC Cancer. 2014 Dec 23;14:994. [Résumé PubMed PMID 25535400]
  • Karsli-Ceppioglu S, Dagdemir A, Judes G, Ngollo M, Penault-Llorca F, Pajon A, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Epigenetic mechanisms of breast cancer: an update of the current knowledge. Epigenomics. 2014;6(6):651-64. [Résumé PubMed PMID 25531258]
  • Ngollo M, Dagdemir A, Karsli-Ceppioglu S, Judes G, Pajon A, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon DJ. Epigenetic modifications in prostate cancer. Epigenomics. 2014;6(4):415-26. [Résumé PubMed PMID 25333850]
  •  Ngollo M, Dagdemir A, Judes G, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Lebert A, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Epigenetics of prostate cancer: distribution of histone H3K27me3 biomarkers in peri-tumoral tissue. OMICS, Mar 2014;18(3):207-9. [Résumé PubMed PMID 24517089]
  • Adjakly M, Ngollo M, Lebert A, Dagdemir A, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Comparative effects of soy phytoestrogens and 17β-estradiol on DNA methylation of a panel of 24 genes in prostate cancer cell lines. Nutr Cancer. 2014;66(3):474-82. [Résumé PubMed PMID 24641702]
  • Dagdemir A, Durif J, Ngollo M, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Breast cancer: mechanisms involved in action of phytoestrogens and epigenetic changes. In Vivo. 2013 Jan-Feb;27(1):1-9. [Résumé PubMed PMID 23239847]
  • Dagdemir A, Durif J, Ngollo M, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Histone lysine trimethylation or acetylation can be modulated by phytoestrogen, estrogen or anti-HDAC in breast cancer cell lines. Epigenomics. 2013b Feb;5(1):51-63. [Résumé PubMed PMID 23414320]
  • Adjakly M, Ngollo M, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Genistein and daidzein: different molecular effects on prostate cancer. Anticancer Res. 2013 Jan;33(1):39-44. [Résumé PubMed PMID 23267126]
  • Rabiau N, Dantal Y, Guy L, Ngollo M, Dagdemir A, Kemeny JL, Terris B, Vieillefond A, Boiteux JP, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Gene panel model predictive of outcome in patients with prostate cancer. OMICS, 2013, 17(8):407-13. [Résumé PubMed PMID 23758475]
  • Bosviel R, Garcia S, Lavediaux G, Michard E, Dravers M, Kwiatkowski F, Bignon YJ, Bernard-Gallon DJ. BRCA1 promoter methylation in peripheral blood DNA was identified in sporadic breast cancer and controls. Cancer Epidemiol. 2012 Jun;36(3):e177-82. [Résumé PubMed PMID 22402307]
  • Bosviel R, Dumollard E, Dechelotte P, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Can soy phytoestrogens decrease DNA methylation in BRCA1 and BRCA2 oncosuppressor genes in breast cancer? OMICS. 2012 May;16(5):235-44. [Résumé PubMed PMID 22339411]
  • Bosviel R, Durif J, Dechelotte P, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Epigenetic modulation of BRCA1 and BRCA2 gene expression by equol in breast cancer cell lines. Br J Nutr. 2012 Oct;108(7):1187-93. Epub 2012 Jan 5. [Résumé PubMed PMID 22217331]

 Dans des journaux scientifiques francophones

  • Adjakly M, Ngollo M, Dagdemir A, Judes G, Pajon A, Karsli-Ceppioglu S, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Le cancer de la prostate: les principaux facteurs de risque et les facteurs protecteurs - Les modifications épigénétiques. Ann Endocrinol (Paris). 2015 Feb;76(1):25-41. [Résumé PubMed PMID 25592466]
  • Ngollo M, Lebert A, Daures M, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D, Guy L. Étude de la marque H3K27me3 à l'échelle du génome : mise en place d'un profil épigénétique en fonction de l'agressivité du cancer de la prostate. Prog Urol. 2015 Nov;25(13):757. [Résumé PubMed PMID 26544280]