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Réseau NACRe

Equipe NACRe 20 : Département d’Oncogénétique du Centre Jean Perrin - CBRV

Inserm U 1240, Clermont-Ferrand - Cancéropôle CLARA

Pr Yves-Jean Bignon, directeur
© Inra, 2017
L'équipe étudie les marques épigénétiques méthylantes et acétylantes dans les cancers sporadiques du sein et de la prostate et leurs tissus sains correspondants. Les effets de différentes substances telles que les œstrogènes et phyto-estrogènes mais aussi différents traitements bloquant les acétyltransférases, déacétylases, méthyltransférases et déméthylases sur la modulation des marques des histones dans les cancers hormonodépendants du sein ou de la prostate sont étudiés.

Pr Yves-Jean Bignon, directeur

Centre biomédical de recherche et de valorisation
28, place Henri Dunant, BP 38
63001 Clermont-Ferrand cedex 1

Correspondante NACRe : Dominique Bernard-Gallon
  

BERNARD-GALLON Dominique

HDR
Ingénieur Biologiste CJP

BIGNON Yves-Jean

HDR, MD
PU-PH CJP

GUY Laurent

HDR, MD
PU-PH CHU

IDRISSOU Mouhamed

Doctorant
2ème année

RIFAI Khaldoum

Doctorant
3ème année

Approche spécifique de la thématique

De nombreuses études montrent que la modification des histones serait associée au développement et à la progression du cancer. Les modifications post-traductionnelles des histones sont essentielles pour la régulation transcriptionnelle des gènes.

Dans le cas du cancer de la prostate, une étude par microarrays a permis d’établir la distribution de H3K27me3 à l’échelle du génome en relation avec les paramètres clinicopathologiques. Le profil d’expression d’une vingtaine de gènes a montré une discrimination significative par analyse transcriptomique à l’aide de TaqMan Low Density Arrays (TLDA) sur des biopsies de prostate représentant deux groupes tumoraux (score de Gleason > 7 et ≤ 7) et un groupe sain.

D’autre part, dans le cas du cancer du sein nous avons étudié le pourcentage de recouvrement des 3 modifications de l’histone H3 dont l’acétylation (H3K4ac et H3K9ac) et la méthylation (H3K27me3) sur le promoteur d’un panel de gènes. L’analyse réalisée sur 192 tumeurs du sein et leurs tissus sains associés a mis en évidence des signatures épigénétiques permettant de caractériser les différents sous-types moléculaires du cancer du sein (Classification de St-Gallen).

Publications récentes dans la thématique Nutrition et Cancer

Dans des journaux scientifiques internationnaux

  • Rifaï K, Idrissou M, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Breaking down the contradictory roles of histone deacetylase sirt1 in human breast cancer. Cancers (Basel). 2018 Oct 30;10(11). pii: E409. [Résumé PubMed PMID 30380732]
  • Rifaï K, Judes G, Idrissou M, Daures M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. SIRT1-dependent epigenetic regulation of H3 and H4 histone acetylation in human breast cancer. Oncotarget. 2018 Jul 17;9(55):30661-78. [Résumé PubMed PMID 30093977]
  • Judes G, Dubois L, Rifaï K, Idrissou M, Mishellany F, Pajon A, Besse S, Daures M, Degoul F, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. TIP60: an actor in acetylation of H3K4 and tumor development in breast cancer. Epigenomics. 2018 Nov;10(11):1415-30. [Résumé PubMed PMID 30324811]
  • Daures M, Idrissou M, Judes G, Rifaï K, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. A new metabolic gene signature in prostate cancer regulated by JMJD3 and EZH2. Oncotarget. 2018 May 4;9(34):23413-25. [Résumé PubMed PMID 29805743]
  • Idrissou M, Rifaï K, Daures M, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Exciting history of Tip60 and its companions in carcinogenesis across the heterochromatin landscapes. OMICS. 2018 Sep;22(9):626-8. [Résumé PubMed PMID 30106669]
  • Rifaï K, Idrissou M, Daures M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. SIRT1 in colorectal cancer: a friend or foe? OMICS. 2018 Apr;22(4):298-300. [Résumé PubMed PMID 29584552]
  • Rifaï K, Judes G, Idrissou M, Daures M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. Dual SIRT1 expression patterns strongly suggests its bivalent role in human breast cancer. Oncotarget, Oncotarget. 2017 Dec 6;8(67):110922-30. [Résumé PubMed PMID 29340027]
  • Judes G, Dubois L, Rifaï K, Daures M, Idrissou M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. TIP60 histone acetyltransferase in adipose tissue: possible linkages with breast cancer development? OMICS. 2017 Nov;21(11):684-6. [Résumé PubMed PMID 28873018]
  • Idrissou M, Daures M, Jemia AB, Judes G, Rifaï K, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. EZH2 histone methyltransferase and JMJD3 histone demethylase implications in prostate cancer. OMICS. 2017 Dec;21(12):751-3. [Résumé PubMed PMID 29161520]
  • Karsli-Ceppioglu S, Dagdemir A, Judes G, Lebert A, Penault-LLorca F, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. The epigenetic landscape of promoter genome-wide analysis in breast cancer. Sci Rep. 2017 Jul 26;7(1):6597. [Résumé PubMed PMID 28747748]
  • Ngollo M, Lebert A, Daures M, Judes G, Rifai K, Dubois L, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Global analysis of H3K27me3 as an epigenetic marker in prostate cancer progression. BMC Cancer. 2017 Apr 12;17(1):261. [Résumé PubMed PMID 28403887]
  • Judes G, Rifaï K, Daures M, Dubois L, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. High-throughput «Omics» technologies: New tools for the study of triple-negative breast cancer. Cancer Lett. 2016 Nov 1;382(1):77-85. [Résumé PubMed PMID 26965997]
  • Judes G, Dagdemir A, Karsli-Ceppioglu S, Lebert A, Dauplat MM, Rifaï K, Daures M, Dubois L, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. Molecular and epigenetic biomarkers in luminal androgen receptor: a triple negative breast cancer subtype. OMICS. 2016 Oct;20(10):610-13. [Résumé PubMed PMID 27326890]
  • Dagdemir A, Judes G, Lebert A, Echegut M, Karsli-Ceppioglu S, Rifaï K, Daures M, Ngollo M, Dubois L, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Epigenetic modifications with DZNep, NaBu and SAHA in luminal and mesenchymal-like breast cancer subtype cells. Cancer Genomics Proteomics. 2016 Jul-Aug;13(4):291-303. [Résumé PubMed PMID 27365379]
  • Judes G, Dagdemir A, Karsli-Ceppioglu S, Lebert A, Echegut M, Ngollo M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. H3K4 acetylation, H3K9 acetylation and H3K27 methylation in breast tumor molecular subtypes. Epigenomics. 2016 Jul;8(7):909-24. [Résumé PubMed PMID 27424567]
  • Daures M, Ngollo M, Judes G, Rifaï K, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. The JMJD3 histone demethylase and the EZH2 histone methyltransferase in prostate cancer. OMICS. 2016 Feb;20(2):123-5. [Résumé PubMed PMID 26871869]
  • Judes G, Rifaï K, Ngollo M, Daures M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D. A bivalent role of TIP60 histone acetyl transferase in human cancer. Epigenomics. 2015;7(8):1351-63. [Résumé PubMed PMID 26638912]
  • Ollier M, Radosevic-Robin N, Kwiatkowski F, Ponelle F, Viala S, Privat M, Uhrhammer N, Bernard-Gallon D, Penault-Llorca F, Bignon YJ, Bidet Y. DNA repair genes implicated in triple negative familial non-BRCA1/2 breast cancer predisposition. Am J Cancer Res. 2015 Jun 15;5(7):2113-26. [Résumé PubMed PMID 26328243]
  • Karsli-Ceppioglu S, Ngollo M, Judes G, Penault-LLorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. The role of soy phytoestrogens on genetic and epigenetic mechanisms of prostate cancer. Enzymes. 2015;37:193-221. [Résumé PubMed PMID 26298461]
  • Karsli-Ceppioglu S, Ngollo M, Adjakly M, Dagdemir A, Judes G, Lebert A, Boiteux JP, Penault-LLorca F, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Genome-wide DNA methylation modified by soy phytoestrogens: role for epigenetic therapeutics in prostate cancer? OMICS. 2015 Apr;19(4):209-19. [Résumé PubMed PMID 25831061]
  • Ngollo M, Lebert A, Dagdemir A, Judes G, Karsli-Ceppioglu S, Daures M, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. The association between histone 3 lysine 27 trimethylation (H3K27me3) and prostate cancer: relationship with clinicopathological parameters. BMC Cancer. 2014 Dec 23;14:994. [Résumé PubMed PMID 25535400]
  • Karsli-Ceppioglu S, Dagdemir A, Judes G, Ngollo M, Penault-Llorca F, Pajon A, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Epigenetic mechanisms of breast cancer: an update of the current knowledge. Epigenomics. 2014;6(6):651-64. [Résumé PubMed PMID 25531258]
  • Ngollo M, Dagdemir A, Karsli-Ceppioglu S, Judes G, Pajon A, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon DJ. Epigenetic modifications in prostate cancer. Epigenomics. 2014;6(4):415-26. [Résumé PubMed PMID 25333850]
  •  Ngollo M, Dagdemir A, Judes G, Kemeny JL, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Lebert A, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Epigenetics of prostate cancer: distribution of histone H3K27me3 biomarkers in peri-tumoral tissue. OMICS, Mar 2014;18(3):207-9. [Résumé PubMed PMID 24517089]
  • Adjakly M, Ngollo M, Lebert A, Dagdemir A, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Comparative effects of soy phytoestrogens and 17β-estradiol on DNA methylation of a panel of 24 genes in prostate cancer cell lines. Nutr Cancer. 2014;66(3):474-82. [Résumé PubMed PMID 24641702]
  • Dagdemir A, Durif J, Ngollo M, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Breast cancer: mechanisms involved in action of phytoestrogens and epigenetic changes. In Vivo. 2013 Jan-Feb;27(1):1-9. [Résumé PubMed PMID 23239847]
  • Dagdemir A, Durif J, Ngollo M, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Histone lysine trimethylation or acetylation can be modulated by phytoestrogen, estrogen or anti-HDAC in breast cancer cell lines. Epigenomics. 2013b Feb;5(1):51-63. [Résumé PubMed PMID 23414320]
  • Adjakly M, Ngollo M, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Genistein and daidzein: different molecular effects on prostate cancer. Anticancer Res. 2013 Jan;33(1):39-44. [Résumé PubMed PMID 23267126]
  • Rabiau N, Dantal Y, Guy L, Ngollo M, Dagdemir A, Kemeny JL, Terris B, Vieillefond A, Boiteux JP, Bignon YJ, Bernard-Gallon D. Gene panel model predictive of outcome in patients with prostate cancer. OMICS, 2013, 17(8):407-13. [Résumé PubMed PMID 23758475]

 Dans des journaux scientifiques francophones

  • Daures M, Idrissou M, Bignon YJ, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon G, Guy L. Analyse transcriptomique d’un panel de gènes dans le cancer de la prostate et implication de la déméthylase JMJD3 et de la méthyltransférase EZH2. Progrès en Urologie 2017. 27(13):719.
  • Adjakly M, Ngollo M, Dagdemir A, Judes G, Pajon A, Karsli-Ceppioglu S, Penault-Llorca F, Boiteux JP, Bignon YJ, Guy L, Bernard-Gallon D. Le cancer de la prostate: les principaux facteurs de risque et les facteurs protecteurs - Les modifications épigénétiques. Ann Endocrinol (Paris). 2015 Feb;76(1):25-41. [Résumé PubMed PMID 25592466]
  • Ngollo M, Lebert A, Daures M, Penault-Llorca F, Bernard-Gallon D, Guy L. Étude de la marque H3K27me3 à l'échelle du génome : mise en place d'un profil épigénétique en fonction de l'agressivité du cancer de la prostate. Prog Urol. 2015 Nov;25(13):757. [Résumé PubMed PMID 26544280]