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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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Inra Productions Animales

Des animaux plus robustes : un enjeu majeur pour le développement durable des productions animales nécessitant l’essor du phénotypage fin et à haut débit

INRA Prod Anim 27(3) 181-194

F. PHOCAS¹,², J. BOBE³, L. BODIN⁴,⁵,⁶, B. CHARLEY⁷, J.-Y. DOURMAD⁸,⁹, N.C. FRIGGENS¹⁰,¹¹, J.-F. HOCQUETTE¹²,¹³ , P.-Y. LE BAIL³ , E. LE BIHAN-DUVAL¹⁴, P. MORMÈDE⁴,⁵,⁶, P. QUÉRɹ⁵,¹⁶, F. SCHELCHER¹⁷,¹⁸

1 INRA, UMR1313 GABI, F-78352 Jouy-en-Josas, France

2 AgroParisTech, UMR1313 GABI, F-75231 Paris, France

3 INRA, UR1037 LPGP, F-35000 Rennes, France

4 INRA, UMR1388 GenPhySE, F-31326 Castanet-Tolosan, France

5 Université de Toulouse INPT ENSAT, UMR1388 GenPhySE, F-31326 Castanet-Tolosan, France

6 Université de Toulouse INPT ENVT, UMR1388 GenPhySE, F-31076 Toulouse, France

7 INRA, Virologie et immunologie moléculaires, F-78352 Jouy-en-Josas, France

8 INRA, UMR1348 PEGASE, F-35590 Saint-Gilles, France

9Agrocampus Ouest, UMR1348 PEGASE, F-35000 Rennes, France

10 INRA, UMR791 MoSAR, F-75005 Paris, France

11 AgroParisTech, UMR791 MoSAR, F-75005 Paris, France

12 INRA, UMR1213 Herbivores, F-63122 Saint-Genès-Champanelle, France

13 Clermont Université, VetAgro Sup, UMR1213 Herbivores, BP 10448, F-63000 Clermont-Ferrand, France

14 INRA, UR83 Recherches Avicoles, F-37380 Nouzilly, France

15INRA, UMR1282 ISP, F-37380 Nouzilly, France

16Université François Rabelais, UMR1282 ISP, F-37200 Tours, France

17 INRA, UMR 1225 IHAP, F-31076 Toulouse, France

18 Université de Toulouse, INP, ENVT, UMR1225 IHAP, F-31076 Toulouse, France

Résumé

L’enjeu majeur du phénotypage animal est d’acquérir une connaissance systémique de la robustesse des animaux d’élevage pour répondre au mieux à une double finalité en termes d’exploitation de la variabilité des aptitudes animales : une sélection éclairée vers des objectifs majeurs pour améliorer l’efficience et la robustesse des génotypes, et un élevage de précision exploitant la variabilité individuelle des animaux pour gagner en résilience à l’échelle du troupeau, ou pour améliorer la conduite à génotype donné. Deux défis majeurs de connaissance, interdépendants et communs à toutes les filières animales, sont à relever pour améliorer la robustesse des animaux : i) comprendre et prédire les compromis entre fonctions vitales, c’est-à-dire les changements de priorités dans l’allocation de ressources limitées ; ii) comprendre et exploiter les aspects temporels de la robustesse au cours de la vie de l’animal pour lui permettre de maintenir son niveau de production dans une large gamme d’environnements sans pour autant compromettre sa reproduction, sa santé et son bien-être. Atteindre ces objectifs nécessite de lever les verrous techniques suivants : i) définir des phénotypes complexes à partir de l’intégration de données obtenues à différentes échelles moléculaires, tissulaires, de l’animal ou d’une de ses fonctions ; ii) mettre en oeuvre des technologies à haut débit pour caractériser à moindre coût et le plus précisément possible le plus grand nombre d’animaux ; iii) développer d’importantes bases de données, des méthodes et outils informatiques performants, nécessaires aux traitements des informations à des fins de modélisation et de biologie prédictive.

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