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SPS - Saclay Plant Sciences

PAPPSO fait le buzz

06 février 2017

PAPPSO
La Plateforme de protéomique PAPPSO (Plate-forme d'Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest), commune aux centres Inra de Versailles-Grignon et Jouy-en-Josas, développe des logiciels open source, entièrement libres et gratuits.
  • Un atelier de 4 jours qui a fait le plein de participants à deux reprises, fin 2016 et début 2017, avec respectivement 26 et 24 personnes venues de toute la France pour s'initier au fonctionnement des différents outils bioinformatiques proposés par PAPPSO.
  • Un article publié par PAPPSO dans la revue Journal of Proteome Research fin 2016: X!TandemPipeline: a tool to manage sequence redundancy for protein inference and phosphosite identification. Olivier Langella, Benoît Valot, Thierry Balliau, Mélisande Blein-Nicolas, Ludovic Bonhomme and Michel Zivy. J Proteome Res, Ahead of print 19/12/16. DOI 10.1021/acs.jproteome.6b00632
  • X!TandemPipeline cité sur le blog d'un chercheur américain comme « une stratégie réellement futée pour grouper les phosphopeptides », un commentaire de protéomiste heureux d’avoir trouvé un outil adapté à ses données, preuve que la réputation des outils de PAPPSO atteint l’échelle internationale.

Tout cela montre bien que le rayonnement des outils de la plateforme PAPPSO s’accroît progressivement en France et à l'étranger !

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