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Résumé : 

C’est dans la zone littorale des grands lacs que les plus fortes densités humaines sont observées dans les Pays de Savoie. Cet écosystème de transition soumis à de fortes pressions est fortement artificialisé : par exemple plus 80% du littoral du Léman est emmuré ou enroché. Ceci a probablement un impact sur le fonctionnement écologique.

L’objectif de cette thèse est de tester une méthode innovante basée sur le séquençage ADN haut-débit de biofilms pour mesurer la biodiversité des poissons, des macroinvertébrés (insectes, mollusques, crustacés) et des algues (diatomées). Cette mesure haut-débit devra permettre d’évaluer l’impact de l’artificialisation du littoral sur le fonctionnement biologique de cet écosystème particulièrement fréquenté. Cette innovation devrait remplacer les échantillonnages et analyses microscopiques traditionnels couteux main d’œuvre. Ceci permettra in fine d’analyser un grand nombre d’échantillons.

Encadrants : A. Bouchez, F. Rimet

Démarrage de la thèse : 1 octobre 2018